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복합표본자료분석 - 3. EDA (R)R 2019. 12. 28. 20:47
이전 포스트에서 EDA에 대해 다루려 했는데, 예제 논문을 따라가다 보니 너무 큰 문제가 보여 더 이상 진행하는 게 의미가 없어 도중에 중단했다. 사실 이런 경우는 굉장히 흔한데, 예상치 못한 일이 발생한 경우 무시하고 넘어가는 것보다 문제를 해결할 방법을 고민하거나 도저히 안 되겠는 경우 중단하는 게 차라리 낫다. 그런 이유로 해외 논문 중 먼저 만들어 놓은 자료를 이용할 수 있는 논문을 찾아서 EDA과정부터 다시 진행해 보려고 한다. Gangwisch, J. E., Malaspina, D., Boden-Albala, B., & Heymsfield, S. B. (2005). Inadequate sleep as a risk factor for obesity: analyses of the NHANES I...
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복합표본자료분석 - 2½. EDA 도중에 포기한 예 (R)R 2019. 12. 19. 14:46
인터넷 뉴스를 보면 건강 관련 기사가 굉장히 많다. 그중에 일부는 의학이나 보건 관련 연구에 대한 기사이다. 최근 일부 기관에서 구성원들의 연구결과가 언론을 탄 경우 업적평가에 가산점을 주거나 심지어는 인센티브를 제공하는 경우까지 제공하는 경우가 있어서 이런 일들이 점점 더 늘어나는 추세이다. 근데 또 그중의 상당수는 국건영과 같은 공개자료를 이용한 연구이다. 앞에서도 계속 언급했듯이 이러한 공개자료를 사용하는 경우 자료 수집에 드는 노력과 비용을 아낄 수 있으며, 개인적인 노력으로는 국건영과 같은 한국인을 대표하는 자료를 얻을 수 없다는 장점이 있다. 그 반면에 자료에 대한 충분한 이해 없이 공장에서 찍어낸 듯한 저 퀄리티의 연구결과가 난립한다는 점은 오히려 국민건강과 전문가에 대한 국민의 신뢰도를 떨..
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복합표본자료분석 - 2. 자료준비 (R)R 2019. 12. 18. 21:42
이전 포스트에서는 복합표본분석 에 대한 기본 개념에 대해 알아보았다. 이제부터 분석을 위한 자료 준비에 들어가 보자. 1. 국건영 자료 다운로드 국건영 홈페이지에 들어가면 간단한 이메일 인증만으로 자료를 다운로드 받을 수 있다. 누누히 얘기 하는 내용이지만 자료 분석 전 홈페이지에 있는 원시자료 이용지침서를 충분히 숙독한 후 분석을 진행해야 한다. 국건영 자료가 굉장히 좋은 자료임에도 불구하고 자료에 대한 이해도가 부족한 상태에서 날림으로 만들어진 논문들이 범람하고 있다. 분석에 R을 사용하는 연구자라도 국건영 자료는 SPSS 파일을 받아서 분석을 시행해야 할 뿐 아니라 변수에 대한 세부적인 내용을 파악하기 위해서 홈페이지에 있는 SPSS 이용지침서, 그리고 분석하려는 변수가 들어있는 해당 년도 자료의 ..
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복합표본자료분석 - 2. 자료준비 (SPSS)SPSS 2019. 11. 19. 19:49
이전 포스트에서는 복합표본분석 에 대한 기본 개념에 대해 알아보았다. 이제부터 분석을 위한 자료 준비에 들어가 보자. 1. 국건영 자료 다운로드 국건영 홈페이지에 들어가면 간단한 이메일 인증만으로 자료를 다운로드 받을 수 있다. 누누히 얘기 하는 내용이지만 자료 분석 전 홈페이지에 있는 원시자료 이용지침서를 충분히 숙독한 후 분석을 진행해야 한다. 국건영 자료가 굉장히 좋은 자료임에도 불구하고 자료에 대한 이해도가 부족한 상태에서 날림으로 만들어진 논문들이 범람하고 있다. SPSS사용자라면 홈페이지에 있는 SPSS 이용지침서, 그리고 분석하려는 변수가 들어있는 해당 년도 자료의 분석 지침서를 충분히 읽어본 후 분석을 진행해야 한다. 2. 자료의 가로결합 국건영과 같이 대형 자료는 통상적으로 한 해의 분석..
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복합표본자료분석 - 1. 기본개념 (SPSS & R)의학논문작성 2019. 11. 19. 19:49
몇 년전까지만 해도 논문을 쓰기 위해서는 아무리 좋은 아이디어를 가지고 있더라도 대표성을 지니는 자료의 수집이 하나의 장벽처럼 작용했었다. 하지만 최근에는 국민건강영양조사(이하 국건영) 자료를 필두로 여러 종류의 공개자료들이 있어 이런 문제점이 많이 해소되었다. 하지만 이를 다루기 위해서는 기존의 분석법과 약간 다른 분석법이 필요하다. 이 내용을 하나의 포스트에 담기에는 양이 너무 많기 때문에 1. 기본개념, 2. 분석자료준비, 3. 복합표본분석 의 3개 포스트로 나누어 진행할 예정이다. 1. 자료를 얻는 방법 논문 작성을 위해 설문지 뿌려 본 사람은 대부분 이게 얼마나 힘들고 돈이 드는 작업인지 뼈저리게 느끼고 있을 것이다. 더욱이 뭔 검사라도 하나 하려면 난이도는 두배 세배로 늘어나게 된다. 결국 대..
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생존분석 (SPSS)SPSS 2019. 11. 17. 19:54
생존분석은 의학연구에서 굉장히 흔히 쓰이는 분석기법이지만, 꽤 흔한 빈도로 잘 못 사용되는 분석법 이기도 하다. 언뜻 생존분석은 로지스틱 회귀분석과 비슷하다는 생각이 들 수도 있지만, 생존분석에는 시간이라는 개념이 들어가기 때문에, 시간에 따른 변화를 읽어내지 못한 채 분석을 하게 되면 잘못된 결과를 얻을 수 있다. 거기에다 SPSS의 생존분석에는 이러한 오류를 찾아내고 교정할 수 있는 방법이 결여되어 있어 특히 더 주의를 요한다. 개인적인 생각으로는 생존분석을 시행하는데 SPSS를 쓰지 않는게 좋겠다고 말하고 싶지만 여러 이유로 SPSS를 제외하고는 선택지가 없는 경우도 있기 때문에 무조건 강요하기도 힘든 것이 사실이다. 이에 이번 포스트에서는 생존분석의 실질적인 측면에 대해 살펴보기로 하자. 1. K..
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생존분석 (R)R 2019. 11. 15. 16:14
생존분석은 의학연구에서 굉장히 흔히 쓰이는 분석기법이지만, 꽤 흔한 빈도로 잘 못 사용되는 분석법 이기도 하다. 언뜻 생존분석은 로지스틱 회귀분석과 비슷하다는 생각이 들 수도 있지만, 생존분석에는 시간이라는 개념이 들어가기 때문에, 시간에 따른 변화를 읽어내지 못한 채 분석을 하게 되면 잘못된 결과를 얻을 수 있다. 이번 포스트에서는 생존분석의 실질적인 측면에 대해 살펴보기로 하자. 1. Kaplan-Meier curve 상당수의 의학논문에서 생존분석을 이용해서 분석을 하는 경우, Kaplan-Meier curve를 제시하고 그 후 cox 분석을 주요분석법으로 사용한다. Kaplan curve를 보여주는 이유는 아무래도 단조로운 논문에 그래도 그림이 하나쯤은 필요하기 때문이기도 하지만 더 큰 이유는 co..
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로지스틱회귀분석 (SPSS)SPSS 2019. 9. 10. 12:47
분석 > 회귀분석 > 이분형 로지스틱 이전까지는 주로 선형회귀분석방법에 대해 알아보았다. 선형회귀분석법은 다른 분석방법을 배우기 위한 기본과정이기 때문에 많은 시간을 할애해서 배울 필요성이 있기는 하지만, 실제로 논문작성에서 그리 많이 사용되는 방법은 아니다. 하지만 이번에 다룰 로지스틱회귀분석법은 극단적으로 말하자면 관찰연구의 대부분을 차지하는 방법이다. 아마 대부분의 임상의사는 로지스틱회귀분석+생존분석으로 평생 욹어 먹을 가능성이 크다. 그런 만큼 세심히 알아보자. 1. 로지스틱회귀분석의 기본원리 원래 학문적 배경이 수학이나 통계 쪽이 아니라서 숫자 나오면 두통이 발생하기 시작한다. 하지만 그래도 이해를 위해 어쩔 수 없이 알아야 하는 과정이 존재한다. 머리 덜 아프게 그리스식 알파벳은 사용 않고 ..